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非标定量(Label-free)
非标记定量(label-free)蛋白质组学按其原理主要分为两种方法:1) Spectrum counts类的非标记定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。 2) 以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的积分,Maxquant是现代高灵敏度质谱(High resolution of modern spectrometers)结果的分析软件,已经渐渐成为蛋白质组学领域内的标准解决方案之一。
实验流程
1. 蛋白提取和酶解
2. label free
3. 质朴分析
4. 蛋白定性定量
5. 生信分析
结果展示
实验周期及交付标准
1. 实验周期:6周左右
2. 交付标准:蛋白定量结果、鉴定结果、质谱原始数据、生信分析结果(GO分析、KEGG分析等等)
需确认的信息
1. 样本的种属
2. 样本的类型(组织or细胞or血液)
3. 样本的数量及分组
4. 分析要求