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实验原理
首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,最后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析,通过相应的数据库检索匹配,一次可鉴定成百上千个修饰位点。
蛋白分析的应用
1. 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;
2.糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;
3.乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;
4.泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;
5.甲基化:染色质结构及转录调控等;
6.丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。
实验流程
1.蛋白提取;
2.蛋白酶消化;
3.修饰肽段富集
4.LC-MS/MS分析;
4.生信分析。
实验完成周期及交付标准
1. 周期:6周左右
2. 交付标准:质谱原始数据、蛋白鉴定列表、修饰位点鉴定表、实验报告(主要仪器、试剂和实验方法)
需确认的信息
1. 确认样品所属种属、分析需求。
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